各位老师好,我要分析的基因家族没有fa. pep. gff3. 和cds文件,请问还有其他办法进行分析吗?

NCBI中只有fna.和gbff,其他的网址没有这个物种,真的不知道怎么做了,球球各位老师帮帮忙。

请先 登录 后评论

1 个回答

生信老顽童

NCBI上的genebank里应该可以提取出蛋白序列以及cds序列,不过过程很繁琐麻烦,初学者操作不了的。建议找找其他数据库有没有基因组。
另外,找找基因组发表的文章,可以问作者要一下基因组的文件。一般作者都会提供给你的。

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,3038 浏览
  • 如太阳一样 提出于 2020-05-03 14:18

相似问题