gff3文件(如下图)里,ID,parent后面的序列登录号后缀不一样。是因为这个问题吗?一直不知道怎么解决。
用的命令是:perl ../script/get_gene_exon_from_gff.pl -in1 Carb_anhydrase_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt -in2 ../Phaeodactylum_tricornutum.ASM15095v2.47.gff3 -out gene_exon_info.gff
图1
图2
把 gene: 还有transcript: cds: 删除试试吧:
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