请教:基因结构分析时,输出的gene_exon_info.gff文件为空。该如何解决?

gff3文件(如下图)里,ID,parent后面的序列登录号后缀不一样。是因为这个问题吗?一直不知道怎么解决。

用的命令是:perl ../script/get_gene_exon_from_gff.pl -in1 Carb_anhydrase_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt -in2 ../Phaeodactylum_tricornutum.ASM15095v2.47.gff3 -out gene_exon_info.gff



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图1

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图2

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

把 gene: 还有transcript: cds: 删除试试吧:

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