如何查到一个转录因子结合到什么样的序列上?
要预测转录因子的结合位点,主要包括3步:
1. 首先鉴定一下是哪一类的转录因子,不同家族的转录因子其结合序列不一样
2. 通过数据库,查询转录因子的结合序列的特征谱,这个可以通过jaspar 这个网站来完成。
3. 基因转录因子结合序列的特征谱,在基因的启动子区域进行扫描,预测结合位点和序列