stringtie分析后没有基因名字 - 组学大讲堂问答社区

5 stringtie分析后没有基因名字

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在用stringtie进行转录本组装拼接定量后，从服务器上下载定量后的文件t_data.ctab文件，打开后发现gene_names一列没有基因名字，在R中用ballgwon包进行差异基因筛选后发现，同样没有基因名字，这是为什么呢？我的参考基因组和注释文件都是从ENSEMBLE网站上下载的。并且我发现我的FC值都比较大，但P值符合<0.05的要求，这样是不是不正常的？

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分类：转录组

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2020-05-19 10:41

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

MSTRG开头的基因是组装的新基因，没有基因名字的：

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