在您TCGA-基因差异表达分析课程中,数据下载中提取Gene表达量矩阵时您用到了perl脚本,但是视频里您没有将如何在自己的电脑里运行。我双击您写的perl脚本,或者用cmd命令行,都运行失败。恳请您百忙之中予以解答,万分感谢~
1. 你可以看看里面的代码,是需要3个参数
perl gtf_extra_biotype.pl biotype_classs.txt gencode.v22.annotation.gtf gene
perl gtf_extra_biotype.pl biotype_classs.txt gencode.v22.annotation.gtf lncRNA
2. 如果你有兴趣的话, 建议你学习一下perl 课程:
《Perl语言快速入门》 和 《Perl语言高级编程》