TCGA目前公开的数据主要包括:
1. 基因结构变异: SNP, Indel ,CNV
2. 转录组数据:基因表达,miRNA表达
3. 表观遗传: 甲基化
4. 临床信息: 病例信息,样本信息,随访信息等 这些数据都可以从GDC上进行下载。
如果下载数据,可以参考我的两篇文章:
《TCGA数据下载》
《下载TCGA临床信息》