什么是测序深度和覆盖度?

基因组denovo测序中测序深度和覆盖度是什么意思?

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红橙子

测序深度:指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为1G,测序深度为10X,那么获得的总数据量为10G;覆盖度是指测序组装出的序列占该物种整个基因组的比例。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的原因,目前测序手段还无法组装出物种的全部序列信息,而没有拼接出的区域就称为Gap。

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  • 红橙子 提出于 2018-09-19 23:10

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