基因家族成员命名和定位

下面图片是有篇文章中的统计表，而我现在分析的结果中（另一个物种）只有Protein ID，请问：（1）Gene name是怎么命名的呢？（2）文章中Locus ID 指的是我的结果中的gene ID 吗？（3）Scaffold的位置信息应该怎么查找呢？另外，请问老师这些表格中的信息是一个个粘贴过来的吗？

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分类：基因家族分析

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omicsgene - 生物信息 2018-09-20 09:43

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你上图中的命名规则我不是很清楚，你不需要理解别人的命名规则，

你要理解自己的数据，基因的信息都记录在基因组的gff文件里面，你仔细看一下gff文件内容，包括基因的位置信息，基因的ID，基因的转录本ID等等信息都有的；

GFF3文件说明：https://www.omicsclass.com/article/306

看你截图的文件是gtf格式，这个格式的文件可由Gff文件转换过来，内容大同小异；你看懂了gff文件，gtf文件也就看懂了；

基因家族成员命名和定位

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