在GDC数据库下载数据出错

老师您好!我在使用你们提供代码在GDC数据库下载数据在询问目录下载TCGA-CHOL项目时候用R跑代码提示以下错误请老师帮我看看谢谢!

GDCdownload(query = query,

+             directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client')

Downloading data for project TCGA-CHOL

试开URL’https://gdc.cancer.gov/files/public/file/gdc-client_v1.6.0_Windows_x64-py3.7_0.zip'

Content type 'application/zip' length 16207515 bytes (15.5 MB)

downloaded 440 KB


Error in unzip(basename(bin)) : zip名字参数不对

此外: Warning message:

In if (grepl("^https?://", url)) { : 条件的长度大于一,因此只能用其第一元素

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

把下载的方法改成method="api" 试一下; 或者换个网速快的网络环境;

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  • 申智勇 提出于 2020-08-08 17:43

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