老师，在ensemble下载斑马鱼和大黄鱼的时候，gff3文件和pep等的ID不统一的，老师给的脚本无法使用，我现在还没能看懂脚本并修改（捂脸） - 组学大讲堂问答社区

老师，在ensemble下载斑马鱼和大黄鱼的时候，gff3文件和pep等的ID不统一的，老师给的脚本无法使用，我现在还没能看懂脚本并修改（捂脸）

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2 个回答

生信老顽童 2020-08-15 12:36

你最好贴一下你的gff文件，我们才能给你提出修改建议。

ζั͡海底明月✾ 2020-08-18 12:44

好的，老师，这个gff文件的问题就是这样，然后我就卡住了（哭）

期待老师的解答~

omicsgene

你这个是有些麻烦，但是可以写个脚本把pep.fa文件里面的ID交换一下就好了；

omicsgene

可以用perl写一下这个脚本：https://www.omicsclass.com/article/179

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ζั͡海底明月✾ 提出于 2020-08-15 00:05