TCGA COX教程里的cut off值是2500,
请问老师
1、这个值是怎么计算出来的?
2、文献里一般都用risk score中位值作为cut off进行高低风险分组,然后再通过ROC曲线确定最佳cut off再进行高低风险分组。教程里的这个cut off是否恰当?为什么不用risk score做cut off,发文章该怎么解释?
1. 2500 : 这个是估计的中位生存期。 准确的数字应该是2888 。
2. ROC 曲线,我们采用的是risk score ,选择的时间是估计的中位生存期。你可以细看一下survivalROC 这个函数。