5 Seurat 直接读取的表达矩阵可以是经过log2plus1和normalizaed to 10,000 counts per cell的矩阵吗？需要转化成raw count吗？

attachments-2020-09-4GCtCPiD5f50f1d12fc23.png在GEO里下的处理后的表达矩阵，是经过标化和scale的，如图，请问这种矩阵可以直接作为seurat的对象吗


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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

GEO的数据标准化之后是可以直接使用的；

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  • AzuraAva 提出于 2020-09-03 21:40

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