老师,用视频教的方法用linux系统查找复制基因的时候,得到了duplication_gene.out文件,但是里边的成对基因不在同一染色体上,请问是我分析出了问题,还是它不属于串联重复基因,属于片段重复?下面这是操作过程我用到的文件:先进行了AABB30-cds的blast比对,得到图1的out文件,然后用了图3的程序,得到复制基因的,请问老师,这个是怎么回事

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

根据串联重复基因判断条件筛选一下就好了,

这个脚本不会筛选染色体和位置信息,需要你手动筛选;

老师,也就是说我提取到的基因对确实是重复基因,只不过需要自己手动分辨它是串联重复还是大片段复制,是这个意思吗

对的

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