10 WGCNA模块数量过少是为什么

老师们好,用几个GSE数据集的DEGs(约300个)做wgcna找hub gene, 结果出来只有两种module(蓝青),,感觉结果有点奇怪……这种正常吗?是因为基因数量太少了吗

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

基因数量太少,不建议用差异基因做,而是用所有基因的表达量做WGCNA分析; 

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