1.基因家族hmmsearch用的多，uniprot网站上不知道你怎么找的，不好评论；
2.基因差异较大可以适当删除一下gap；https://www.omicsclass.com/article/221
3.如果要删除基因，文章直接写出筛选的e值就可以了；如下：
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-018-4880-x#Sec12
5 基因家族成员鉴定
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老师，我用hmmsearch共找到了58个成员，在Uniprot网站上也找到了58个成员，请问如果能在蛋白网站上能找到的话还有必要用hmmsearch搜索吗？
另外，用这58个序列做进化树，失败了，其中两个序列明显与其它不同（图中12和25号），请问我应该怎么筛掉呢（写到文章里）？我手动把E-value卡在0.00000001以下时即可把这两个序列去掉了，但是这没法往文章里写啊~
