如何将unigene的所有基因和我的目的基因进行blast比对,有专门的软件吗,谢谢。

您好,网上看到您回答了一个网友的问题,

请问如何从无参转录组的fasta数据中,找到一些拟南芥的同源序列,比如拟南芥的LHY基因,在fasta数据中能找到吗?

您建议拿目的基因和无参转录组组装得到的unigene进行blast,比对率高的可能就是同源基因。我想问下unigene基因序列很多,怎样和目的基因进行blast比对呢,有专门的软件吗,我现在初学这些,十分感谢呢。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你已经知道了用blast比对就好了;

这里用有课程你学习一下使用blast:

学习blast安装使用课程见:


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或者用hmmer搜索,基因家族分析课程也可以:
https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp
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  • alice 提出于 2020-10-19 12:43

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