在使用mapman注释非模式植物时,为什么得出的结果没有相应的基因ID呢?

老师:

       您好!在使用mapman注释非模式植物时,为什么得出的结果没有相应的基因ID呢?(下图)

attachments-2018-09-vcxOv67F5bb02dd71395f.jpg下面这张图是我导进去的FASTA文件

attachments-2018-09-51ctJ9XD5bb02df123e9b.jpg望指教,谢谢!

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最佳答案 2018-09-30 10:27

参考下图:

1、如果该基因被注释到某一个bin   会在文件第三列对应出现ID   如图中1;

2、在所有bin对应的分类中,并不是每一个都能被注释上基因(指你提供的那些基因),会出现空的情况

3、还有一些是在bin 分类中对应的M 类型,对应的都是一些蛋白酶之类的,如图中2,这个并不是你注释上的bin。

结合以上,你截的图应该是上面3说的。。。。也就是说,你看错了地方,去看那些对应基因ID的才是你注释到的,也就是关注图中1所示结果即可。


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