GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

你好,我对这个GEO2R分析时,数据分组不理解。

在GEO中检索出所有样品之后,选择Define groups,选定差异比较分组的样品(如果是多平台数据,请先确定平台)。在Define groups下拉输入框中,先输入control,点击Enter键,确定第一个分组,同样输入第二个分组tumour,设定第二组。(注意先后顺序,对照在前,处理在后)。

选中样品之后,点击分组(control or tumour),例如案例中control选中了三个样品,tumour选中三个样品,具体见下图。

我看有的时tumor组在前,所以我先问问 这个比较的是肿瘤组处理对照组吧,那这个分组是根据你下面罗列的样本的顺序命名吗?

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  • 关君君 提出于 2020-12-05 11:10

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