老师您好，是关于基因家族分析的，我是小白，刚开始做相关分析，有些迷糊。一个软体动物的SOX基因家族鉴定与分析，最后鉴定出两条序列同属于一个类群（SOXH）的基因，这两条序列结构域完全一致，结构域之外有几个氨基酸位点不同，但是相关文献里都没提到过软体动物这个类群（SOXH）会有基因组的复制，不过其中有一篇提到过这个类群有三种可变剪切形式。（相关知识不太够，想问一下是哪里出了问题，基因组注释cds和pep文件里可能会存在可变剪切吗？或者是基因组有问题吗
可变剪切 其实就是一个基因多个转录本的形式，一个基因有多个转录本就会有多个蛋白和cds序列；
这些基础的生物知识还是要了解的；
基因复制是两个完全不一样的两个基因；
你这个再查查资料吧； 看看基因是否有复制现象，如果没有，可能是基因组组装或者注释错误吧；
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