基因组间共线性分析

做基因组间共线性分析时,/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.synteny screen --minsize=0 --minspan=30 --simple ATH.rapa.anchors   ATH.rapa.anchors.new,过滤的命令中的30是什么意思,做单子叶植物和双子叶植物基因家族共线性分析时候,minspan=30时没有得到共线性的基因,这个30最小可以设定为多大,谢谢老师!

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

没有得到,可能是其他原因,你再查查;

设的小一些运行一下,可以自己测试的; 

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