老师，您好，我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的第一个方法中操作 pick_de_novo_otus.py 这一步，缺少了很多文件，之后我又单独操作的，在操作第三步 # Assign taxonomy command 时，没有出现qiime_rep_set_tax_assignments.txt 这个文件，第四步也没有办法操作，是哪里出问题了呢 - 组学大讲堂问答社区

老师，您好，我在16S数据实操中的qiime聚类生成otu的第一个方法中操作 pick_de_novo_otus.py 这一步，缺少了很多文件，之后我又单独操作的，在操作第三步 # Assign taxonomy command 时，没有出现qiime_rep_set_tax_assignments.txt 这个文件，第四步也没有办法操作，是哪里出问题了呢

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分类：转录组

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2 个回答

小野猫 2021-01-11 18:11

方法二和三也运行不了，脚本所在的目录已经添加到了环境中了(T＿T)

omicsgene - 生物信息 2021-01-14 13:37

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

电脑内存不够，系统自动杀死了进程；

建议至少16G以上的内存才可以运行，。

docker 中内存调整：https://www.omicsclass.com/article/1413

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小野猫提出于 2021-01-10 19:52