因为现在安装的blast+的版本太高,所以里面没有blastall这个,那基因家族分析中共线性分析的下面这个用到的命令,怎么修改成blastp或者blastn的脚本方式

blastall -i AT_pep.fa -d AT_pep.fa -e 1e-10  -p blastp  -b 5 -v 5 -m 8 -o mcscan/AT.blast 这个命令怎么改成blsatp或者blastn等的命令,这个是比较蛋白吧,应该用的是blastp?如果用blastp的时候,这个命令怎么修改?

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

blast+的用法见这里:https://www.omicsclass.com/article/269

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,1987 浏览
  • 杨辉 提出于 2021-02-04 23:31

相似问题