进行基因家族共线性分析的时候，拟南芥的可以提取到蛋白序列，但是另外物种在提取蛋白的的时候，pep.fa文件是空的？最后一节课的解决CDS文件提取不成功的方法不适用此问题

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跟拟南芥一样，也是转录本第一个是在基因名后面加的.1，为什么提取不了蛋白序列呢

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我看了一下蛋白序列文件中的转录本ID都是后面加的.1, 跟拟南芥的差不多啊，为啥提取不出来呢

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

拟南芥的可以成功，你再对比一下输入文件内容，是否写错；我看看你输入的gff文件和你查看的gff文件不一样

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  • 杨辉 提出于 2021-02-06 00:37

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