根据WGCNA课程中给的script进行操作的。上面两张图分别显示了run了> install.packages("WGCNA")和# Load the WGCNA package library(WGCNA)之后的代码。
请求帮助,非常感谢!
相关的包也需要安装,它提示你还少了GO.db(当然如果还有其他包没有安装的时候,可能也会提示其他的错误)建议你把相关包依次安装上,或者直接运行下方的命令安装相关包,之后再安装WGCNA
(参考主页:https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/index.html)
相关包的安装:
install.packages(c("matrixStats", "Hmisc", "splines", "foreach", "doParallel", "fastcluster", "dynamicTreeCut", "survival"))
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite(c("GO.db", "preprocessCore", "impute"))
WGCNA安装可参考:
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("WGCNA")