5 在Rstudio安装WGCNA数据包时有程辑包不能获得,直接输入了> install.packages("WGCNA")代码下载的。文中有图

attachments-2018-10-TD6eEPvp5bbd594299c37.jpg

attachments-2018-10-V6cS7Rte5bbd594dadea9.jpg根据WGCNA课程中给的script进行操作的。上面两张图分别显示了run了> install.packages("WGCNA")和# Load the WGCNA package library(WGCNA)之后的代码。

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最佳答案 2018-10-10 11:06

相关的包也需要安装,它提示你还少了GO.db(当然如果还有其他包没有安装的时候,可能也会提示其他的错误)建议你把相关包依次安装上,或者直接运行下方的命令安装相关包,之后再安装WGCNA

attachments-2018-10-lRqnPrwj5bbd606adb2ff.jpg(参考主页:https://horvath.genetics.ucla.edu/html/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/index.html

相关包的安装:

install.packages(c("matrixStats", "Hmisc", "splines", "foreach", "doParallel", "fastcluster", "dynamicTreeCut", "survival")) 
source("http://bioconductor.org/biocLite.R") 
biocLite(c("GO.db", "preprocessCore", "impute")) 

WGCNA安装可参考:

install.packages("BiocManager") 
BiocManager::install("WGCNA") 
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其它 3 个回答

Maggie

已经安装了老师给的两个包,感谢老师的解答!

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我听。你说

The following object is masked from ‘package:stats’:


    hclust


错误: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):

 不存在叫‘AnnotationDbi’这个名字的程辑包

老师,我按照你的这个方法去安装,不知道为什么会出现这个问题呢?
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Baiansy

老师您好,请问按照您的方法输入后,出现这样的报错是什么原因呢?我该如何解决啊,孩子哭晕

attachments-2021-11-Bt0cT2vS61823966d6cf1.png

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