没有组装到染色体,可以把scaffold看成染色体来做,但是通常scaffold很多,如果做共线性绘图的话显示的片段太多,不好看;如果非要做的话,你可以选一些片段比较长的scaffold做一下,但是结果肯定是不完整的;
生物学意义:由于scaffold不知道哪些是在一条染色体上的,无法准确的发现基因祖上的大片段的到位复制事件,串联重复一般两个基因挨得很近,由于不知道完整基因组,所以只能发现scaffold上挨得很近的基因,基因组碎片化,会丢失很多信息;
没有组装到染色体,可以把scaffold看成染色体来做,但是通常scaffold很多,如果做共线性绘图的话显示的片段太多,不好看;如果非要做的话,你可以选一些片段比较长的scaffold做一下,但是结果肯定是不完整的;
生物学意义:由于scaffold不知道哪些是在一条染色体上的,无法准确的发现基因祖上的大片段的到位复制事件,串联重复一般两个基因挨得很近,由于不知道完整基因组,所以只能发现scaffold上挨得很近的基因,基因组碎片化,会丢失很多信息;
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