基因家族成员鉴定分析中，比如WORK基因：为什么要进行两次hmmer（一次WORKhmmer搜索，一次拟拟南芥hmmer搜索）搜索？意义是什么？还有就是第二次搜索出来的结果为什么还要手动检验一下？第二次搜出来的结果不就是有woKY结构域的才能被搜出来吗？（听了您基因家族分析的课，会操作点了，但不懂原理） - 组学大讲堂问答社区

5 基因家族成员鉴定分析中，比如WORK基因：为什么要进行两次hmmer（一次WORKhmmer搜索，一次拟拟南芥hmmer搜索）搜索？意义是什么？还有就是第二次搜索出来的结果为什么还要手动检验一下？第二次搜出来的结果不就是有woKY结构域的才能被搜出来吗？（听了您基因家族分析的课，会操作点了，但不懂原理）

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omicsgene - 生物信息 2021-04-09 16:22

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

不了解WORK 基因家族，

最好的办法你看看别人文献中是否进行二次搜索，如果是你也做二次搜索就是了；

一般保守的家族只做一次搜索就可以，一些进化快差异大的家族会做二次搜索；

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sunny 提出于 2021-04-08 15:06