按照图片中的代码输入文件数据,能够读出dim(FPKM)和names(FPKM)。但是datExpr0命令之后是显示一串空白之后,显示omitted 30 rows(即全部数据都没读出来)。我是把excel表格中的所有数据复制,直接粘贴到新建的txt文件中的,然后再Rstudio中读取txt文件。
下图是我直接读取xls表格文件的代码显示情况。也是不能读取数据。不知道我准备的文件的错误在哪里。
下面两张图是我准备的FPKM的数据文件:xsl和txt格式的。
烦请解答,十分感谢!
并没有报错,应该是文件格式有问题,omitted 30 rows指的应该是省略30行,不是没读出来,你在read.table函数里面试试调一下分隔符参数吧read.table(sep="\t“)之类的,从警告和结果来看,是文件格式的问题。
另 R语言读取文件名的时候,文件的命名最好不要出现空格,单词之间尽量连起来,用大小写或者下划线来区分