老师好,我看您的帖子中说用qiime cutadapt demux-paired时,可以自己分别选定mapping file 中forward和reverse的barcode。但是我在使用qiime2-cutadapt时提示并没有m-reverse-barcode-file 和m-reverse-barcode-column的选项呀。
你说的是这个帖子吗?https://www.omicsclass.com/article/1397
参数指定的是meta文件里面的列名;不是文件;
如果觉得我的回答对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!
请问现在的qiime cutadapt demux-paired 可以处理只有反向序列存在barcode的情况吗?
和楼上一样,我的样品里只在反向序列上加了barcode,请问现在的qiime cutadapt demux-paired 拆分只有反向序列存在barcode的数据如何操作呢?
我试过把--m-forward-barcodes-file sample-metadata.tsv \
--m-forward-barcodes-column forward-barcodes \
这两行删掉,但是出错了,请问该如果解决呢?谢谢。