镜像版本是: v1.2版本吗? 保持版本一致;
再检查一下你的输入文件,qiime.fasta 文件格式是不是qiime要求的格式,或者截图出来我看看;
或者是内存不够,找个内存高的电脑重新分析。
如果觉得我的回答对您有用,请随意打赏。你的支持将鼓励我继续创作!
assign_taxonomy.py -o uclust_assigned_taxonomy -i otus.fa -m uclust \
--reference_seqs_fp $SEQ --id_to_taxonomy_fp $TAX --similarity 0.8
我也是这一步一直运行不过去,给了最大内存和CPU
这是我现在的内存,docker里的,用这个分析qiime1,注释时候还是会报错,segmentation fault。