老师,我用的就是课程里的代码,分配了6个g,还是报错了,麻烦老师看看是哪里不合适Segmentation fault uclust

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3 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

镜像版本是: v1.2版本吗?   保持版本一致;attachments-2021-06-XzPe1oLd60b6e66d27efc.png


再检查一下你的输入文件,qiime.fasta 文件格式是不是qiime要求的格式,或者截图出来我看看;


或者是内存不够,找个内存高的电脑重新分析。

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今天就要努力

assign_taxonomy.py -o uclust_assigned_taxonomy -i otus.fa -m uclust \

    --reference_seqs_fp $SEQ --id_to_taxonomy_fp $TAX --similarity 0.8


我也是这一步一直运行不过去,给了最大内存和CPU

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小程

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这是我现在的内存,docker里的,用这个分析qiime1,注释时候还是会报错,segmentation fault。

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