请问不同疾病，不同的GSE号可以联合起来做WGCNA分析吗？可以的话是否要把两个矩阵合并？如何合并？你的多个矩阵是怎么一起做WGCNA分析的呢 - 组学大讲堂问答社区

请问不同疾病，不同的GSE号可以联合起来做WGCNA分析吗？可以的话是否要把两个矩阵合并？如何合并？你的多个矩阵是怎么一起做WGCNA分析的呢

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omicsgene - 生物信息 2021-06-15 09:40

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

最好不要，这样会有批次效应，如果联合应该去除一下批次效应，R中sva包可以去除：https://www.omicsclass.com/article/1113

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细水长流提出于 2021-06-07 15:18