一般序列较多,bootstrap设置1000次构建进化树需要的时间较长;这个和自己的电脑配置有关,以前做过500个基因,bootstrap 设置1000,用时1天时间,不过我们是在大型计算机上完成的; 普通计算机用时会更长。
还有就是选用的方法,ML方法用时最长,NJ法用时会少一些;
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