TPM标准化

转录组TPM标准化需要基因的长度信息,这个基因的长度是指基因本身的长度,还是CDS的长度?

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1 个回答

microRNA

外显子的长度。

有几个相关的概念,你可以了解一下。

RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads 

FPKM: Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments

RPM/CPM: Reads/Counts of exon model per Million mapped reads 

TPM:Transcripts Per Kilobase of exon model per Million mapped reads 

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  • 夜空 提出于 2018-10-16 20:57

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