转录组分析中,针对新的转录本进行长链非编码RNA的预测,有什么软件可以预测?
lncRNA(long noncoding RNA): 长链非编码RNA主要的一点,就是无法编码一个完整的蛋白质,基于这个特点,有很多方法可以对蛋白编码潜能进行预测,比如序列相似性,密码子的分布情况等特征,再结合一些机器学习的算法,基于这些特征进行预测。1. CPC
2. CPAT
3. CNCI
4.phyloCSF