lncRNA预测的软件有那些?

转录组分析中,针对新的转录本进行长链非编码RNA的预测,有什么软件可以预测?

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microRNA

lncRNA(long noncoding RNA): 长链非编码RNA主要的一点,就是无法编码一个完整的蛋白质,基于这个特点,有很多方法可以对蛋白编码潜能进行预测,比如序列相似性,密码子的分布情况等特征,再结合一些机器学习的算法,基于这些特征进行预测。
1. CPC 

2. CPAT

3. CNCI

4.phyloCSF


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  • zhangqx 提出于 2018-07-06 14:04

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