样品聚类树高度能反映样品的离群程度,比较远的表示这些样品可能存在异常,样本分布不均衡,会影响网络模块分析结果,故剔除这些样品,而实际的结果一般通过聚类树具体的情况判断,设置阈值进行剔除。你这个图片的标准多数时按经验来的,譬如你明显看到了这四个样属于离群状态,所以设置一个高度进行了剔除,裁掉"树枝”中“叶”节点高度明显高于其他的样本。这种情况下的描述也多是:明显高于其他样品 故剔除(你设3000剔除结果也一样)。
不过离群样本的剔除也可以按照其他的方式来 https://www.omicsclass.com/article/141