我做的核桃,数据是按无参基因组分析的,以拟南芥为参考基因组。现在核桃的基因组也已经公布了。请问,我应该怎么分析我的miRNA的启动子呢?
1. 如果需要分析启动子序列,需要采用参考基因组,请采用核桃的基因组,提取启动子序列。
2. 以预测的miRNA的成熟体序列在参考基因组上找到对应的区域,如果找到的位置比较多,需要结合miRNA的前体序列,找到准确位置。