3 Fst与Pi联合,筛选受选择区域

老师,您好。我再用vcftools计算Fst和Pi时,设置的窗口步长是一致的,但是跑出来的结果有一些区域出现了跳过的情况,导致两个文件的窗口不一致,如图所示,pi值的范围直接从15w到了50我,怎么解决这一问题呢?attachments-2022-03-SmknMBZY622213f159331.pngattachments-2022-03-3JrAjdxI622213f6b9f99.png

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你可以查看一下你的VCF文件,这段应该是没有SNP,直接跳过了;

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,2363 浏览
  • Sun 提出于 2022-03-04 21:29

相似问题