不同物种共线性分析结果只有一对同源基因被发现，怎么检查是不是中间有出错，没有找到其他的基因

我做的拟南芥同十字花科作物的某个基因家族分析，我在用白菜和拟南芥做共线性分析的时候，发现白菜所有基因都能在拟南芥中找到同源基因，但是用另一个同属的物种确实只发现一个与拟南芥同源基因。因为之前做进化树分析的时候，这个物种中鉴定到的所有基因都能和拟南芥还有白菜中的该基因家族的基因分类相同。所以怀疑是不是我做的哪里出了问题。毕竟进化树分类的时候和白菜和拟南芥的都能归类到一起