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老师您好,我在进行连锁不平衡分析时,在这一步遇到了问题,这是什么原因呀,我的分组是这样的,是不是因为我的每个分组里只有一个样品才不行呀
群体结构分析
0 条评论
分类:
重测序
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omicsgene
- 生物信息
2022-04-07 10:59
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
样本太少不能做连锁不平衡分析;不是群体。
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Invincible
提出于 2022-04-06 21:01
相似问题
群体结构分析时,执行代码报错
0 回答
老师您好,我问过我们这边的一个老师,他是直接用的我的plink_pca.eigenvec文件直接在R绘制的,并且没有用我的分组信息,直接PCA就可以做出来图,他说可能是我的分组有点问题,但是我用这个分组可以完成进化树和structure绘图,做PCA的图却只有框没有点
1 回答
老师您好,我在fasttree构建系统发育树这一步,程序会被kill掉,看不到报错,前面的程序运行的都没有问题,唯一的一处报错出现在给vcf文件排序这里,但是这一步生成文件了 而且下一步转换格式也没有问题,这个该怎么解决呀
1 回答
老师您好,群体结构分析自己的数据时,进行到文件格式转换那一步遇到了问题,报错写的是要将vcf文件正常排序,我自己在网上找到了相应的脚本,却不能正常运行,报错写的是不能生成JAVA虚拟机,我的脚本是不是有什么问题呀,这个应该怎么解决呀
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