您好,请问您annovar的报错问题:
如何解决的呢?
有些参考基因组里面有一些 ambiguous 碱基 ,ANNOVAR处理不了,这是作者的回答:https://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/misc/faq/
解决办法就是将 ambiguous 碱基根据IUPAC :(https://www.omicsclass.com/article/409 )编码替换成一单个碱基;
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