老师,您好,请问我的基因组下载不了GTF文件,有的是gff3文件,文件如下,不知道是否可以拿来尽力索引?

attachments-2022-05-LPPb5mY0628059d5d852c.png我建立的索引得到的是以下文件,其中splicesites.tsv文件是空的,不知道什么原因,是不是gff3文件有问题啊?

attachments-2022-05-lwzs6oVY62805a60d54aa.png

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

将CDS行复制一下,吧CDS 改成exon

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请问为什么要复制CDS行,直接把CDS换成exon不行吗?

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