老师您好!请问下图1中红方框中的碱基序列长度修改是否可以根据文件“2.fastqc”中的“multiqc_report.html”中图2的bp平均值进行相应修改,如果可以,那么修改原则是什么,是数据集中的波峰前取值还是波峰中间取值,比如图2波峰是300bp,那么我是否可以取值280?
这个length required 是把小于这个值的序列删除;
你这个设置个280bp左右即可;保留大部分的read
还有就是你的引物扩增的区域(V3?V4 or V3+V4?) 长度做参考;
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谢谢老师,我的是V4-V5区域,和您示例中的V3-V4有差异,就如您所说的,还是得根据自己的实际情况适当修改