老师们好！
我在用Qiime2做16S V3-V4的分析，是直接拿到公司的测序数据，已拆分但未去接头。我去接头序列后用dada2做了去噪，原本10万 reads/sample在去嵌合体后一下子降到1万左右，前序步骤merged reads还有一半以上（如下图）。且能得到357个特征序列。
然后我联系了公司技术人员，用他们建议的参数和步骤（省去去接头，直接用dada2）得到了2万的非嵌合序列，但也很明显他们这个过程里merged reads少了（如下图）。而且特征序列也只得到319个。
因此我很怀疑是测序过程中建库有问题，希望能得到老师们经验方面的指导，谢谢！
