执行fastqc $datadir/*.gz -o $workdir/1.fastqc报错

在学习GWAS课程,章节3-05数据质控这一节时候,执行上述命令报错,报错为

Exception in thread "Thread-3" java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded

at java.lang.String.toCharArray(String.java:2899)

at uk.ac.babraham.FastQC.Modules.BasicStats.processSequence(BasicStats.java:123)

at uk.ac.babraham.FastQC.Analysis.AnalysisRunner.run(AnalysisRunner.java:89)

at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

我退出Linux系统,并把内存改为9G时候,仍然报错,与上述一样的错误,

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  • 芥末扁桃仁 提出于 2022-07-26 14:05

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