vcf2hmp.pl 报错：ERROR: invalid genotype call at marker position

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2022-08-10 16:46

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

修改升级一下脚本：

插入以下代码：

            elsif ($call[0] =~ /1[\/\|]0/)
            {
                print OUTFILE "\t", $splitline[4], $splitline[3];
            }