如果前面的共线性分析操作都正确的话;
结果没有就是没有了;
#找到我们分析的基因家族的共线性分析关系(大片段复制现象):
cd /work/my_gene_family/MCScanX
perl /biosoft/MCScanX/MCScanX/downstream_analyses/detect_collinearity_within_gene_families.pl -i crk_family.txt -d mcscan/os.collinearity -o crk.collinear.pairs
这一步分析后,产生的.collinear.pairs文件中,没有找到对应的复制基因,是我分析的基因确实没有加倍与复制,还是输入的crk_family.txt文件格式有问题(确实是制表符分隔的)?
详情见图