PSMC分析得到的psmc.fa文件总为空

PSMC 在最后fq.gz文件转换为psmcfa文件的时候,psmcfa文件为空,未见报错。在进行逐条语句纠错后仍不起效。后根据网络查找更换参考基因组未起效;改变reads深度参数,不起效。测序深度在8x左右,远低于要求的18x,请问是测序深度不够的原因吗?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你是学习我们的课程吗?

测序深度不够不行的;得不到好结果;18X说的是最低要求,一般我们做的时候30X以上吧

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  • 陈晓生 提出于 2022-09-23 18:09