扩增子高级分析R语言代码

老师,在学习扩增子高级分析群落数据co-occurrence network分析,运行代码network=net_pro(igraph) 出现报错 Error in average.path.length(igraph) : At core/paths/shortest_paths.c:188 : Weight vector must be non-negative, got -0.509662. Invalid value

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2 个回答

xun - 电路元件工程师

之间的应该是阈值设的较低导致的权重向量问题,我们已经在最新版本修复了这种情况,可以重新去百度网盘下载这部分的内容

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可能是输入数据的问题,OTU太少,丰度太低等原因;

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  • .、 提出于 2022-10-08 14:41

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