在用WGCNA进行模块与性状数据分析的时候，做出如下热图，模块与性状之间的关联特别小，不知道这是因为数据本身引起的还是分析过程中设置的数据不合理？谢谢~

5 在用WGCNA进行模块与性状数据分析的时候，做出如下热图，模块与性状之间的关联特别小，不知道这是因为数据本身引起的还是分析过程中设置的数据不合理？谢谢~

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abline(h = 1000000, col = "red")

minModuleSize = 80

MEDissThres = 0.35

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分类：TCGA

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2 个回答

Daitoue 2018-11-12 10:10

改改相关参数试试，你设置的模块最小也是80，而且相似性不太高1-0.35=0.65，可以尝试调整调整

张婷婷  2018-11-12 16:03

您好，根据您的建议，我修改了相关的参数。abline(h = 800000, col = "red")，minModuleSize = 30，MEDissThres = 0.20，但是出来的模块数量特别多，颜色还是比较浅一些。我想在此基础上减少一下模块的数量，不知道应该继续怎样设置参数？谢谢~以下是这次做出的模块与性状相关的图~

5 在用WGCNA进行模块与性状数据分析的时候，做出如下热图，模块与性状之间的关联特别小，不知道这是因为数据本身引起的还是分析过程中设置的数据不合理？谢谢~

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