关于基因家族成员的分类,我看参考文献中讲的是根据基因结构决定的,我想知道怎么预测他们保守结构域的结构?
另外,核定位信号怎么预测?
再问一个和这个无关的问题,新版的参考基因组和旧版的基因ID表达方式不一样了,请问新旧版的ID怎么对应呢?
1,你的贴图看,只是介绍结构域,你应该看看这篇文章的方法部分,那里会有怎么鉴定结构域的。
保守结构域可以用hmmer搜索的方法,我们基因家族课程里面讲的很详细:《基因家族里课程》
2.核定位信号,没有做过,你看看这篇文章的方法部分是否有介绍定位方法
3. 新旧版本的ID号,这个不好对应,除非基因组发布作者有提供,不然需要自己做共线性分析或者blast比对应ID。
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