5 请问如何预测基因家族蛋白的二级结构?

关于基因家族成员的分类,我看参考文献中讲的是根据基因结构决定的,我想知道怎么预测他们保守结构域的结构?

另外,核定位信号怎么预测?

再问一个和这个无关的问题,新版的参考基因组和旧版的基因ID表达方式不一样了,请问新旧版的ID怎么对应呢?

attachments-2018-11-UQF0TRqz5bea43cbba1ac.jpg

attachments-2018-11-p8UtYty05bea43ad732e3.jpgattachments-2018-11-h4u1UAog5bea43b06dde0.jpg

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

1,你的贴图看,只是介绍结构域,你应该看看这篇文章的方法部分,那里会有怎么鉴定结构域的。

    保守结构域可以用hmmer搜索的方法,我们基因家族课程里面讲的很详细:基因家族里课程

2.核定位信号,没有做过,你看看这篇文章的方法部分是否有介绍定位方法

3. 新旧版本的ID号,这个不好对应,除非基因组发布作者有提供,不然需要自己做共线性分析或者blast比对应ID。

请先 登录 后评论
  • 2 关注
  • 0 收藏,4051 浏览
  • 提出于 2018-11-13 11:30

相似问题