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你好,我想请问一下qq图做出来的这种结果是不是不太好呢,横坐标超过4之后突然就变得很陡峭,这大概是什么原因呢?
GWAS
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GWAS
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omicsgene
- 生物信息
2022-11-19 08:14
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
表型数据有问题吧, 你的表型数据可能有少量离群值,可以去掉试试
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提出于 2022-11-18 16:24
相似问题
GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题
1 回答
老师您好,针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到:你这个数据里面是不是P值有0的情况,取了对数就无穷大了,导致出问题。但是,我发现里面没有P值为0的情况,那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢?需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢?还有,我发现P-Value的原始文件有NaN的情况,是什么原因呢?是否对GWAS有影响呢?
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0 回答
gwas
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